布袋式除塵器的反吹系統是整個除塵器長期運行的。應用較為普遍和廣泛的反吹系統多為脈沖式反吹，此種清灰方式主要是根據反吹氣壓原理來進行的，具有不錯的清灰效果和較高的自動化程度。在使用過程中，系統中出現下列問題需要注意：
1.反吹過程產生較大振動，導致反吹管頻繁出現掉落及倉室進出口翻版，松動，關閉等情況，除塵系統壓差隨之不斷上升除塵效果隨之下降。
2.脈沖式反吹法需要有持續的壓縮空氣來支撐脈沖噴吹工作，一旦壓縮空氣突然停止，
除塵器系統壓差將會出現較大幅度的漲幅，如果不及時恢復，會對布袋產生嚴重破壞。此外，如壓縮空氣中水分含量較高，長期運行，一是會使布袋潮濕，細小的焦粉與布袋粘結導致布袋透風率急劇下降，除塵系統壓差也隨之逐漸升高，將會嚴重降低除塵效果的同時，加劇布袋的損壞速度。二是電磁閥進水無常工作，它所控制的脈沖閥、離線閥也無法動作，使得反吹效果大幅度降低，除塵效果也隨之降低，此現象冬季為明顯。
3.脈沖式反吹法的反吹程序須通過生產節奏及產灰量的大小進行調整，否則無法發揮出布袋除塵的效果。
